Pertandingan terakhir babak penyisihan grup Liga Europa sudah berlangsung pada Jumat dinihari. Berikut tim yang lolos ke babak 32 besar:
Sebagai juara grup:
Fenerbahce, APOEL, Saint-Etienne, Zenit St. Petersburg, Roma, Athletic Bilbao, Ajax, Shakhtar Donetsk, Schalke 04, Fiorentina, Sparta Prague, Osmanlispor FK.
Sebagai runner-up:
Manchester United, Olympiacos, Anderlecht, AZ Alkmaar, Astra Giurgiu, Genk, Celta Vigo, Gent, Krasnodar, PAOK Thessaloniki, Southampton, Villarreal.
Lolos dari Liga Champions:
Copenhagen, Lyon, Tottenham Hotspur, Besiktas, Rostov, Borussia Mönchengladbach, Legia Warsaw, Ludogorets Razgrad.
Undian babak 32 besar akan dilakukan hari Senin, 12 Desember, dan pertandingan akan digelar pada 16 Februari serta 23 Februari 2017.